Dr. Vera Zizka

Postdoc

Naturschutzökologie [17]

Tel: +49 (0)228 9122 354

Fax: +49 (0)228 9122 212

E-Mail: v.zizka [at] leibniz-zfmk.de

[19] [20]

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Projekte

2019

[21]

DINA – Diversity of Insects in Nature Protected Areas [21]

Vor dem Hintergrund des in Deutschland dokumentierten dramatischen Insektenrückgangs in Naturschutzgebieten, fanden in 2018 diverse Besprechungen in einem Konsortium aus Naturschutzbund Deutschland – NABU, Entomologischem Verein Krefeld e.V. – EVK und mehreren Forschungsinstituten statt. Besonderes Merkmal des noch in Begutachtung befindlichen Projektes DINA (Diversität von Insekten in Naturschutz-Arealen) ist ein interaktiver, multidisziplinärer Ansatz zur Integration wissenschaftlicher Ergebnisse mit sozio-ökonomischen Aspekten und der Perspektive von relevanten Teilhabern.

Abteilung/Sektion:

Direktion [22], Naturschutzökologie [17], Forschungsnetzwerke [23], Zentrum für Biodiversitätsmonitoring [24], Verwaltung [25], ZFMK Internationale Graduiertenschule [26], Metabarcoding [27], Zentrum für molekulare Biodiversitätsforschung [28], Herpetologie [29], Diptera [30]

Projektleitung:

Dr. Livia Schäffler [31]

Finanzierung:

Bundesministerium für Bildung und Forschung

Publikationen

Publiziert in

2021

Leese F., Sander M., Buchner D., Elbrecht V., Haase P., Zizka V.M.A. (2021). Improved freshwater macroinvertebrate detection from environmental DNA through minimized nontarget amplification. Environmental DNA, 00:1-16. DOI: 10.1002/edn3.177

[Mehr] [32]

2020

Zizka, V.M.A., Weiss, M., Leese, F. (2020) Can metabarcoding resolve intraspecific genetic diversity changes to environmental stressors? A test case using river macrozoobenthos. - Metabarcoding and Metagenomics 4:23-34.

[Mehr] [33]

Laini, A., Beermann A. J., Bolpagni R., Burgazzi G., Elbrecht V., Zizka V. M. A., Leese F., Viaroli P. (2020) Exploring the potential of metabarcoding to disentangle macroinvertebrate community dynamics in intermittent streams. - Metabarcoding and Metagenomics 4:65-79.

[Mehr] [34]

Leese, F., Beermann, A.J., Zizka, V. unter Mitarbeit von Astrin, J., Bálint, M., Bourlat, S., Buchner, D., Elbrecht, V., Hörren, T., Krehenwinkel, H., Monaghan, M., Morinière, J., Pauls, S.U., Schäffler, L., Weigand, A. 2020 Potenzial genetischer Methoden für die Erfassung und das Monitoring von Insekten. Ausarbeitung im Rahmen des F+E-Vorhabens „Konzeptentwicklung zum bundesweiten Insektenmonitoring"

[Mehr] [35]

Schäffler, L., Zizka, V. & Noll, N. (2020): Sektion Umweltbiologie am Zentrum für Biodiversitätsmonitoring (zbm) - Mitteilungen der Fachgruppe Umweltchemie und Ökotoxikologie der Gesellschaft Deutscher Chemiker, 26. Jahrgang Juni 2020

[Mehr] [36]

Beermann, A. J., Werner, M-T., Elbrecht, V., Zizka, V. M. A., Leese F (2020): DNA metabarcoding improves the detection of multiple stressor responses of stream invertebrates to increased salinity, fine sediment deposition and reduced flow velocity. - Science of The Total Environment 750.

[Mehr] [37]

Elbrecht, V., Bourlat, S.J., Lindner, A., Mordente, A., Noll, N., Sorg, M., Zizka, V. (2020) Pooling size sorted malaise trap fractions to maximise taxon recovery with metabarcoding. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.09.118950v1

[Mehr] [38]

Zizka, V.M.A., Geiger, M.F., Leese, F. (2020): DNA metabarcoding of stream invertebrates reveals spatio-temporal variation but consistent status class assessments in a natural and urban river, Ecological Indicators, Volume 115, 106383. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106383.

[Mehr] [39]

2019

Blackman RC, Mächler E, Altermatt F, Arnold A, Beja P, Boets P, Egeter B, Elbrecht V, et al. (2019) Advancing the use of molecular methods for routine freshwater macroinvertebrate biomonitoring – the need for calibration experiments. Metabarcoding and Metagenomics 3: e34735. https://doi.org/10.3897/mbmg.3.34735

[Mehr] [40]

Links:

https://mbmg.pensoft.net/article/34735/ [41]

Zizka, V. M. A., Elbrecht, V., Macher, J.-N., & Leese, F. (2019). Assessing the influence of sample tagging and library preparation on DNA metabarcoding. Molecular Ecology

[Mehr] [42]

Links:

https://doi.org/10.1111/1755-0998.13018 [43]

2018

Macher, J.-N., Zizka, V.M.A., Weigand, A.M., Leese F. (2018): A simple centrifugation protocol for metagenomic studies increases mitochondrial DNA yield by two orders of magnitude. -Methods in Ecology and Evolution 9 (4): 1070-1074.

[Mehr] [44]

Kuhn, T., Zizka V.M.A, Münster R., Mattiucci S., Kochmann J., Klimpel S. (2018) Lighten up the dark: metazoan parasites as indicators from the ecology of Antarctic crocodile icefish (Channichthyidae) from the north-west Antarctic Peninsula. - PeerJ 6:e4638.

[Mehr] [45]

Beermann, A. J., Zizka, V. M. A., Elbrecht, V., Baranov, V., & Leese, F. (2018). DNA metabarcoding reveals the complex and hidden responses of chironomids to multiple stressors. Environmental Sciences Europe, 1–15.

[Mehr] [46]

Links:

http://doi.org/10.1186/s12302-018-0157-x [47]

Zizka, V., Leese, F., Peinert, B., Geiger, M.F. (2018): DNA metabarcoding from sample fixative as a quick and voucher-preserving biodiversity assessment method.- Genome (na) doi.org/10.1139/gen-2018-0048

[Mehr] [48]

Links:

Genome journal [49]

2017

Lammers, F., Janke, A., Rückle, C., Zizka, V., Nilsson M.A. (2017): Screening for the ancient polar bear mitochondrial genome reveals low integration of mitochondrial pseidogenes (numts) in bears. - Mitochondrial DNA Part B 2 (1): 251-254.

[Mehr] [50]

ab 2020 wissenschaftliche Mitearbeiterin DINA Projekt, Forschungsmuseum Alexander Koenig, Bonn.

2016 - 2019 Promotion "Development and validation of DNA metabarcoding for stream macroinvertebrate community assessment", Universität Duisburg-Essen, Aquatische Ökosystemforschung.

2015 Praktikum "Screening for the ancient polar bear mitochondrial genome reveals low integration of mitochondiral pseudogenes (numts) in bears", Prof. Dr. Axel Janke, Evolutionäre Genomik, Senckenberg Biodiversität und Klima-Forschungszentrum (BiK-F), Frankfurt.

2014 Praktikum "Molecular systematic analyses of the Prasophyllinae (Diurideae, Orchidoideae, Orchidaceae)", Dr. Katharina Schulte, Tropical Herbarium, Cairns, Australia.

2013 - 2015 Master Ökologie und Evolution, Goethe Universität Frankfurt; Abschlussarbeit "Parasite diversity of Antarctic crocodile icefishes (Channichthyidae) from the South Shetland Islands", Prof. Dr. Sven Klimpel, Integrative Parasitologie und Zoophysiologie.

2009 - 2013 Bachelor Biowissenschaften, Goethe Universität Frankfurt und Universität Tromsø; Abschlussarbeit "On the behaviour of the Aye-Aye (Daubentonia madagascariensis)", Prof. Dr. Manfred Niekisch, Zoologischer Garten Frankfurt.

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